バイオインフォマティクス編 『【バイオインフォ編】C言語の老兵、Pythonの海へ。がんという「最凶のマルウェア」をデバッグする新たな武器』
みなさん、こんにちは。64歳のプログラマーです。これまで私は、DNAの仕組みを「ソースコード」に、ゲノム編集を「sed置換コマンド」に例えて、生命OSの仕組みをハックしてきました。現在、私が目指す「がん研究の実験室」への切符を手にするため、...
バイオインフォマティクス編
バイオインフォマティクス編 
バイオインフォマティクス編 『【バイオインフォ編】第3回：生命の未来を予測せよ！データサイエンスとAIが挑む「究極のオブジェクト解析」』
みなさん、こんにちは。64歳のプログラマーです。第1回ではゲノムのデバッグ（変異検出）を、第2回ではそれを自動化する最強のCI/CDパイプライン（Nextflow）をご紹介してきました。最終回となる今回は、集まった膨大なデータから「未来を予...
バイオインフォマティクス編 『【バイオインフォ編】第2回：ゲノム解析の自動化は、生命データをビルドする「最強のCI/CDパイプライン」だった』
みなさん、こんにちは。64歳のプログラマーです。前回は、がんゲノム解析が「30億文字のログから1文字のバグを探すデバッグ作業」であることをお話ししました。数GB〜数百GBの巨大なログファイルを、マッピングして、バイナリに変換して、バグを検出...
バイオインフォマティクス編 『【バイオインフォ編】がんゲノム解析は、30億行のログから「たった1文字のバグ」を探す地獄のデバッグ作業』
みなさん、こんにちは。64歳のプログラマーです。前回までは、DNAの仕組みやゲノム編集を「ソースコードの書き換え」に例えて解説してきました。今回からは番外編として、私が今まさに猛勉強している「バイオインフォマティクス（生物情報科学）」の世界...