全体計画（仕様策定）編 🎯 【連載第4回】ターゲット研究室の「要件定義」。64歳プログラマー、志望校選定という名の仕様策定に挑む
みなさん、こんにちは。64歳のプログラマーです。大学院合格（本番環境デプロイ）に向けた連載ロードマップ、第4回のテーマは「Phase 3：ターゲット研究室の要件定義（志望校選定・訪問編）」です。前回、バイオインフォマティクスの開発環境（Py...
2026-08
全体計画（仕様策定）編 
全体計画（仕様策定）編 💻 【連載第3回】バイオインフォの洗礼。海外製オープンソースは「動かないレガシーコード」？環境構築とのデスマーチ
みなさん、こんにちは。64歳のプログラマーです。大学院合格という本番環境デプロイを目指す連載ロードマップ、第3回のテーマは「Phase 2：バイオインフォマティクス（データ解析・環境構築編）」です。前回、生命科学の基本仕様（基礎知識）を脳内...
全体計画（仕様策定）編 🧬 【連載第2回】分厚い教科書は「オープンソースの仕様書」。64歳プログラマーの生命科学インプット術
みなさん、こんにちは。64歳のプログラマーです。大学院合格（本番環境デプロイ）に向けた連載ロードマップ、第2回のテーマは「Phase 1：生命科学のコアシステム解析（基礎学習編）」です。現在私は、志望する医科学研究室の試験を突破するため、医...
バイオ・がん研究 『【出願1ヶ月前ハック】40年のC言語スキルを「研究計画書」へ完全コンパイル！試験官（レビュー担当）のLGTMをもぎ取るためのリファクタリング戦略』
みなさん、こんにちは。64歳のプログラマーです。未来の予約投稿枠として、教科書第10章の「DNAテクノロジー」のハック連載をすべてリポジトリにコミット（書き溜め）し終えました。ブログの定期デプロイ（予約更新）インフラが整ったところで、今回は...
全体計画（仕様策定）編 🚀 【新連載】64歳C言語プログラマー、大学院（がん研究室）合格への開発計画（ロードマップ）
みなさん、こんにちは。64歳のプログラマーです。これまで当ブログでは、生命科学の不思議をIT用語に翻訳して解説してきました。しかし、私の最終目標は解説者になることではありません。「大学院の医科学研究室に入り、がん研究の最前線に立つこと」です...
院試対策 『【院試対策編】64歳の脳内メモリ改革。記憶の「キャッシュ」が枯渇した脳に、どうやって生命科学データを書き込むか』
みなさん、こんにちは。64歳のプログラマーです。がん研究の実験室入りを目指し、大学院入試に向けてバイオインフォマティクスや生命科学の基礎を猛勉強する日々が続いています。しかし、ここでエンジニアとして非常に深刻な「ハードウェアの限界」に直面し...
バイオインフォマティクス編 『【バイオインフォ編】C言語の老兵、Pythonの海へ。がんという「最凶のマルウェア」をデバッグする新たな武器』
みなさん、こんにちは。64歳のプログラマーです。これまで私は、DNAの仕組みを「ソースコード」に、ゲノム編集を「sed置換コマンド」に例えて、生命OSの仕組みをハックしてきました。現在、私が目指す「がん研究の実験室」への切符を手にするため、...
バイオインフォマティクス編 『【バイオインフォ編】第3回：生命の未来を予測せよ！データサイエンスとAIが挑む「究極のオブジェクト解析」』
みなさん、こんにちは。64歳のプログラマーです。第1回ではゲノムのデバッグ（変異検出）を、第2回ではそれを自動化する最強のCI/CDパイプライン（Nextflow）をご紹介してきました。最終回となる今回は、集まった膨大なデータから「未来を予...
バイオインフォマティクス編 『【バイオインフォ編】第2回：ゲノム解析の自動化は、生命データをビルドする「最強のCI/CDパイプライン」だった』
みなさん、こんにちは。64歳のプログラマーです。前回は、がんゲノム解析が「30億文字のログから1文字のバグを探すデバッグ作業」であることをお話ししました。数GB〜数百GBの巨大なログファイルを、マッピングして、バイナリに変換して、バグを検出...
バイオインフォマティクス編 『【バイオインフォ編】がんゲノム解析は、30億行のログから「たった1文字のバグ」を探す地獄のデバッグ作業』
みなさん、こんにちは。64歳のプログラマーです。前回までは、DNAの仕組みやゲノム編集を「ソースコードの書き換え」に例えて解説してきました。今回からは番外編として、私が今まさに猛勉強している「バイオインフォマティクス（生物情報科学）」の世界...